În scopul rezolvării unor probleme de importanţă majoră pentru stat, se elaborează şi realizează programe speciale complexe. Regulamentul adoptat de Guvern stabileşte bazele juridice, economice şi organizatorice la elaborarea şi realizarea programelor complexe de stat ale Republicii Moldova cu destinaţie specială, determină statutul, tipurile, formele de asigurare materială, financiară şi organizatorică, de stimulare şi control al îndeplinirii lor.
Programul complex cu destinaţie specială (PCDS) este un document ce prevede un ansamblu de măsuri economice, sociale, tehnico-ştiinţifice, de inovare, organizatorice, ecologice şi alte măsuri, orientate spre rezolvarea problemelor de mare importanţă ce ţin de interesul statului, al mai multor ramuri, regiuni pe o cale mai efectivă şi în termenul stabilit.
În dependenţă de nivelul dirijării se disting:
- programe republicane care se realizează pe întregul sau cea mai mare parte a teritoriului republicii, cuprinzând mai multe regiuni cu importanţă naţională;
- programe regionale care se realizează pe teritoriul a câtorva raioane, oraşe;
- programe municipale care se realizează pe teritoriul unei unităţi teritorial-administrative luate aparte;
- programe interramurale sau, în cazuri de mare importanţă, ramurale care se elaborează şi se realizează în cadrul câtorva ramuri interdependente sau al unor ramuri aparte.
- După termenul de realizare programele complexe pot fi: pe termen mediu - o perioadă până la 5 ani, şi pe termen lung - o perioadă mai îndelungată.
La realizarea programelor trebuie respectate principiile:
- prioritatea problemelor, actualitatea şi importanţa realizării lor pentru republică, regiune sau ramură;
- caracterul multiramural şi multiprofil al problemelor;
- fundamentarea soluţionării problemelor;
- noutatea problemelor tehnice, organizatorice, regionale etc. necesare pentru realizarea problemei;
- prezenţa în republică, regiune, ramură a condiţiilor necesare pentru soluţionarea problemei date - resurse financiare, tehnico-ştiinţifice, materiale şi potenţial de producţie;
- finalitatea şi complexitatea soluţionării problemei;
- argumentarea ştiinţifică a programului (existenţa variantelor alternative de soluţionare a problemei, determinarea consecinţelor posibile ce pot urma în rezultatul realizării programului dat, inclusiv negative);
- expertiza independentă;
- asigurarea realizării programului cu resursele necesare, coordonarea resurselor financiare, tehnico-materiale şi de muncă cu termenul soluţionării problemelor de nivel republican, regional sau ramural.
La argumentarea problemelor incluse în programele complexe cu destinaţie specială este necesar de a se ţine cont de priorităţile social-economice, direcţiile politicii structurale, precum şi de necesităţile statului, de rezultatele analizei economice şi starea ecologică.
Cu ajutorul programelor de stat de scară largă pot şi trebuie să fie elaborate în prealabil concepţii ale acestor programe. Elaborarea acestor concepţii se face conform hotărârilor Guvernului sau în baza acordurilor interguvernamentale.
Printre cele mai importante programe care se realizează în republică în timpul de faţă, conform hotărârilor Guvernului pot fi menţionate: Programul dezvoltării în perspectivă a complexului agroindustrial; Programul de dezvoltare al raioanelor de sud ale republicii în perioada de până în anul 2000; Programul de stat privind pregătirea şi perfecţionarea cadrelor în conformitate cu transformările structurale din economia naţională şi tranziţia la economia de piaţă; Programul energetic de stat al republicii pentru anii 1995-2000; Programul investiţional pe termen lung reieşind din direcţiile prioritare de dezvoltare a economiei cu atragerea surselor investiţionale străine; Programul "Conversiunea"; Programul de dezvoltare şi consolidare a bazei tehnico-materiale de producere a materiei prime şi materialelor pentru industria uşoară; Programul de elaborare şi implementare în producţie la întreprinderile Ministerului Industriei a noilor tipuri de maşini agricole pentru asigurarea necesităţilor republicii; Programul de stat de gazificare în republică pentru perioada de până în anul 2000; Programul de stat de dezvoltare a industriei medicale şi farmaceutice; Programul de stat de dezvoltare a culturii în perioada până în anul 2000 şi alte programe.
De menţionat că din lipsă de resurse financiare şi tehnico-materiale realizarea programelor indicate practic este dificilă şi se cer întreprinse măsuri eficace suplimentare.